发简信
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RPKM/FPKM/TPM在RNA-seq分析中的标准化流程在RNA-seq的分析中，需要对基因或者转录本的read counts数进行标准化过程。因为落在一个基因区域内的read counts取决于基因...
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从TCGA数据库下载数据
从TCGA数据库中下载数据的方法有多种，常用的方法有：1.从TCGA官网直接下载（数据量小的话可行，数据量太大就pass）2.用TCGA官方工具...
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数据挖掘20210115学习笔记富集分析：GO、KEGG id转换：bitr() 输入数据：差异基因的entrezid；所有基因的entrezid KEGG GO 处理GEO数...
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数据挖掘20210114学习笔记GEO数据挖掘 图表介绍 1.热图 ·输入数据是数值型矩阵\数据框·颜色的变化表示熟知的大小 2.散点图和箱线图 箱线图：输入数据是一个数值型向...
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数据挖掘20210112学习笔记
tidyr 核心函数 一、数据清理 扁变长(gather-spread) 长变扁 二、分割和合并(separate-unite) 分割 合并 三...
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数据挖掘20210111学习笔记R语言作图 低级绘图函数建立在高级绘图函数基础上，不能单独使用 ggplot2语法 1.入门级绘图模板2.映射-颜色、大小、透明度、形状3.分面...
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数据挖掘20210108学习笔记函数 函数与参数 (1)形式参数与实际参数 (2)写函数的函数 function(){ } (3)默认参数：作者会设计很多参数，但只有前1~n个...
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数据挖掘20210107学习笔记数据结构 Vector向量—一维 Matrix矩阵—二维 矩阵：长度相同、数据类型相同；数据框：长度相同、数据类型可以不相同 List列表 列表...
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数据挖掘20210105学习笔记对单个向量进行的操作 （1）赋值给一个变量名，用“=”或“<-” （2）简单数学计算 （3）根据某条件进行判断，生成逻辑值向量 （4）初级统计 ...