GWAS分析基本流程及分析思路[https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/10129785.html] 数据预处理(DNA genotypin...
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主成分分析(Principal component analysis,PCA)是将多个存在相关关系的变量,降维为几个互不相关的指标,也就是主成分。我的数据相对来说,有点复杂,...
拖拖拉拉用了一年时间才把GWAS整个流程捋完,从背景到code、还有过程中遇到的一些bug以及解决办法,加起来也有二十余篇,按分析的流程整理出一份清单,也许以后有新的方法或者...
一、 DAP-seq技术简介 DAP-seq(DNA亲和纯化测序)技术服务——高通量检测转录因子或DNA结合蛋白在基因组上的结合位点。 在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录...
使用lm()函数建立多元线性回归模型,使用glm()建立广义线性回归模型。 广义线性模型之泊松回归[https://blog.csdn.net/qq_44638724/art...
TBtools 是一个集合了超多生信处理的小工具,非常方便,而且是无命令行的操作,入门门槛极低。开发者是华南农业大学陈程杰博士,TBtools文章地址:https://www...
难道,这不像孔雀开屏吗? 写在前面 组学数据已经泛滥,但是信息的挖掘仍任重道远。顺手的工具,可以节省使用者尽可能多的时间,或者将看起来很复杂,很难以完成的事情,变得非常简单。...
最近休息了几天。没有来得及更新。今天我们来讲一讲热图怎么绘制 什么是热图(Heatmap) 热图是一个以颜色变化来显示数据的矩阵。Toussaint Loua在1873年就曾...
关于相关性,表示数据之间的相互依赖关系。但需要注意,数据具有相关性不一定意味着具有因果关系。 相关性在组学数据挖掘中应用非常广,如样本的重复检验、基因的共表达分析、微生物群落...
关于相关性,表示数据之间的相互依赖关系。但需要注意,数据具有相关性不一定意味着具有因果关系。 相关性在组学数据挖掘中应用非常广,如样本的重复检验、基因的共表达分析、微生物群落...
随着测序成本的不断下降,转录组测序分析已然成为生物学及医学研究不可或缺的技术手段。 但是,对于大多数初学者来说,会遇到各种各样的问题。这里,小编就给大家重点介绍一下转录组测序...
⚠️ 注:此文基本全部按照 简书 刘小泽:转录组那些事儿 Part II 进行,感谢🙏,以下代码亲测有效,如有问题欢迎随时与我沟通。 准备工作😄 1. 登录服务器(本小白...
转录组(transcriptome),额定类型细胞中全体转录本(transcript)的集合,是细胞特定时刻基因表达谱的一个快照(snapshot of expression...
概念及类型: 转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRN...