医学和生信笔记

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R机器学习mlr3：超参数调优
很多人戏称调参的过程就像是"炼丹"！确实差不多，而且很多时候你调整后的结果可能还不如默认的结果好！这就好比打游戏，"一顿操作猛如虎，一看战绩0比...

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R机器学习mlr3：模型评价和比较
前面一篇介绍了如何使用mlr3创建任务和学习器、拟合模型、预测和简单的评价，本篇将模型评价的一些细节问题，展示mlr3如何使得这些步骤变得更加简...

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新版TCGA的突变SNP数据下载和整理
关于TCGAbiolinks包的学习前面一共介绍了5篇推文。今天继续学习如何使用TCGAbiolinks下载和整理MAF格式的突变数据。之前...

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新版TCGA表达矩阵整理简单版
很多人因为网络原因不能使用TCGAbiolinks这个神包下载TCGA的RNA-seq数据，只能通过浏览器访问GDC TCGA的官网进行下载，而...

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TCGA新版数据差异分析
上一篇文章里面简单学习了一下表达矩阵的提取，顺便探索了一下SummarizedExperiment对象。今天学习下用TCGAbiolinks做...

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R语言方差分析
本文首发于公众号：医学和生信笔记，完美观看体验请至公众号查看本文。医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。这是R...

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决策曲线分析DCA用于lasso回归/随机森林
本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析...

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R语言卡方检验大全
本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析...

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R语言t检验
本文首发于公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。主要分享R语言做医学统计学、meta分析...

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