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HTSeq作为一款可以处理高通量数据的python包,由Simon Anders, Paul Theodor Pyl, Wolfgang Huber等人携手推出HTSeq —...
转录组测序的目的之一,就是探索组间显著表达变化的基因——差异表达基因。那么,如何基于转录组测序获得的定量表达值,识别差异表达变化的基因或其它非编码RNA分子呢?DESeq2是...
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程,适用于初学者入门阅读,从原始测序数据开始,经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤,最终获得基因表达信息。...
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RNA-seq 转录组 转录组学(transcriptomics)的研究对象是全基因组尺度下所有转录本(transcript),即转录组(transcriptome) 转录本...
RNA-seq转录组数据分析思路 数据产生 -测序的平台和测序的类型-测序基本原理1.single end 、2.pair end测序、3.mate pair测序-实验设计 ...