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如何从CisBP数据库生成ArchR使用的Motif PWM文件
1. 下载Cisbp数据库中的motif文件 (1) 下载文件 CISBP数据库[http://cisbp2.ccbr.utoronto.ca]...

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使用lftp上传数据到GEO，贼快！推荐
我之前在2021年写过上传数据到GEO数据库获得GEO号[https://www.jianshu.com/p/003ef56dd311]，那时候...

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SCI文章写作以及文章修稿的一点体会
情感: 离上次写笔记快半年之久了，这半年来基本都把心思花在了一个课题上。这两日终于把文章修回去了，静下来心来整理这个课题的结果，想着总结自己这半...

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利用Linux下载阿里云以及诺禾云(诺禾致源)提供的测序数据
早上在处理数据的时候，发现花的时间比预期多出一半，原本计划45分钟完成，花了一个半小时，当然啦，也有摸鱼的水分在啦，哈哈哈哈，然后我想着还是整理...

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肿瘤相关基因数据库
写在前面: 最近需要完成的一个task是看基因是否是oncogene，想了下解决办法，去看看有没有人整理好的oncogene的数据库或者有没有算...

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CellChat 报错"Error in `levels<-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) : factor level [2] is d...
今天在跑CellChat的时候，出现了一个问题"Error in levels<-(*tmp*, value = as.character(le...

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Mac10.15.6 安装MySQL
上次想安装mysql，一直没安装上, 今天想着重新安装下还是安装不上，就到configuration那一步配置不成功，后来发现原来是mac版本问...

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解决 libstdc++.so.6: version ‘GLIBCXX_3.4.29‘ not found 问题
0.问题描述就是我再更新Rstudio中的R版本之后，发现每次都会出现一个问题就是ImportError: /lib64/libstdc++....

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封装函数-用R包Seurat跑单套数据
呜呜最近发现我工作效率低的一个原因就是重复性工作没有流程化，一气之下，把seurat分析单套数据的流程封装了起来，步骤包含数据质控、数据标准化、...

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