240 发简信
IP属地:加州
  • Resize,w 360,h 240
    TCGA数据分析系列(一:数据下载清洗)

    废话不多说,直接上干货。 一、确定肿瘤代码 TCGA涵盖30多种癌症,9000多个病人,数据库里的癌症名称是缩写的形式,TCGA癌症中英文对照可...

  • Resize,w 360,h 240
    HI-C 数据分析pipeline(三:AB compartment 区室计算)

    使用HicPro处理fastq data[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5NDAzNTM0OQ==&mi...

  • HI-C数据分析 pipeline(二:数据格式转换)

    由于HIC数据目前很难用一个软件就能将全套流程全部分析完,从数据预处理到后续的TAD计算,loop计算等需要用到众多软件,但是在数据格式方面,各...

    1.1 8564 0 12
  • HI-C数据分析 pipeline(一:上游数据预处理)

    Hi-C fastq data to valid pair and matrix data format transition.本文总结了Hi-...

  • Resize,w 360,h 240
    3D基因组学在白血病中的研究进展——分子分型、诊断、预后

    2022年10月26日,岳峰/郑弘在《nature》杂志上发表题为 Subtype-specific 3D genome alteration...

  • ATAC-seq数据可视化——超简单教程

    大家好这里是有时候季更,有时候月更的基因组学研究生。上一期记录了ATAC数据从Fastq数据到bam文件的处理脚本。 ATAC数据一键处理基因组...

  • 一个不成熟的小脚本,ATAC数据一键预处理从fastq到treated bam

    数据从下机fq.gz文件到可用的 .bam文件,每次都需要运行去接头,比对,去复,去MT,shift,排序等... 尽管俺把他们都写在了一个...

  • Resize,w 360,h 240
    两条命令就跑完RNA差异分析

    数据分析实在太难了,差异分析到底怎么跑啊,怎么才不出错呀!coldata到底怎么构建呀……!别慌,傻瓜包来了!它就是simpleRNA,居然只要...

    1.1 4440 0 12
  • 文章被分享的感觉真的很不错

    最近在写一些干货类的文章,关注基因组学和生信分析相关的。前几天刚申请的公众号,目前写了2篇了。 昨天发布的一篇《如何快速查找高质量文献及其相关文...

个人介绍
一个基因组学研究生