组学工具合集 整理了一些目前知道的与组学相关的工具,可能不全面,欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler: 最具代表性的工具 二代组装 Minia SP...
最近刚返校,事情比较多,每天也很忙,之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建(上)》也一直没来得及更新,缺少cafe输出结果的解读及后面的可视化。最近在简书上也收到了...
一、4Dtv(四倍简并位点颠换率)的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative) third-codon tr...
写在前面 大量物种的基因组被报道,越来越多的公开可获取数据,使得我们可以针对自己的生物学问题,开展基本的比较基因组分析。鉴于此,有必要搞一个工作台式的功能。于是,我在飞机上写...
写在前面 对于没有做过共线性分析的小伙伴,可以通过以下几段内容,了解一下,我为什么要费劲巴拉画出这样一张图。 除了基因组成的相似性,在不同基因组中基因排列顺序的一致性更能够体...
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....