前面已经说了很多的基础概念和分析算法，但是大家应该注意到了，前面的分析都限制在TCRαβ序列，分析还是具有一定的限制性，今天我们稍微做一下扩展，优化TCR分析距离的同时，分析...
前面的文章中完成了数据导入和网络构建，下面是将基因模块与性状进行关联，从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
1.输入数据要什么 下面这段话摘自CIBERSORT的介绍 Importantly, all expression data should be non-negative, ...
Identification of Angiogenesis-Related Prognostic Biomarkers Associated With Immune Cel...
前面由于对miRNA的探针数目没有正确的理解，以为数据一直没有下载完全，折腾了一番。后来经老大jimmy提醒了，miRNA有2000左右的探针就是正常的呀。所以就可以愉快地继...
1 什么是GSEA 基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)是是一种计算方法，用于确定事先定义的一组基因是否在不同的样品中差异表...
一.研究背景 众所周知，TP53突变是肝细胞癌（HCC）中最常见的突变，它影响着HCC的进展和预后。尽管TP53突变在HCC患者预后中的致病作用已被充分证实，但其对HCC免疫...
前言 我是在y蜀黍的书里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一个叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R语言化了。那么以后想做G...
之前的timeROC曲线图在：(本来这里应该有个链接，可是已经被封了，又不让放别的平台的链接，所以放不了了。)刚刚对它进行了一点调整和升级。 1.输入数据 需要有3列，生存时...
1.需求 为了直观的展示免疫治疗结果与病人风险高低之间的关系，如图： 2.数据 需要病人的高低风险分组，和免疫治疗结果 3.画图代码 因为数据是编的，就不用看high和low...
