现在正是一年一度的毕业季,有人喜也有人悲。有的研究生已经顺利发表相关的论文,满足了毕业的要求;有的研究生还在为发一篇SCI论文而发愁;有的研究生已经选择“躺平”,做好了延毕的...
GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同,更加趋于流程化。 软件安装 点击此处 查看最新版本 GATK 简单说明 GATK分析简要流程 所需数据 ref.fa rea...
FASTQ with Emoji = FASTQE 🤔 表情版的FASTQC,适用于Illumina 1.8+/Sanger format 使用 安装 使用conda 或者p...
编辑shell文件 mem.sh 使用方法:sh mem.sh 程序名
转载的生信技能书的文章,仅用于自己学习记录! 文章原链接为:http://www.bio-info-trainee.com/2775.html ;可以直接去原链接学习。 史上...
转录组还是subread快点
许多电脑没有 root权限的建议使用conda安装Trinity,效果还可以
转录组分析实战第二节:无参考基因转录组拼接Trinity是广泛应用的不依赖基因组的转录组分析工具 我们在这一节中将采用Trinity在服务器端对第一节中获得的cleandata进行转录组拼接 在此过程中我们会涉及软件...
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本文介绍了linux下的压缩程式tar、gzip、gunzip、bzip2、bunzip2、compress 、uncompress、 zip、 unzip、rar、unra...
Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的RNA-Seq数据 转录组组装工具,包括三个模块, Inch...
现在可以用fasterq-dump, 速度更快,请阅读都8102年了,还用fastq-dump,快换fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打过交道,尤...