作者,这个可以加个参数设定产物的大小吗?
qPCR | 荧光定量?批量设计引物,一键搞定!写在前面 Emmm,转录组筛了十来个基因,想着扩大材料看看表达模式是否与数据体现相符,于是需要设计一下qPCR引物。当然,自然是有一些软件可以使用,但用起来不太方便。至少问了...
作者,这个可以加个参数设定产物的大小吗?
qPCR | 荧光定量?批量设计引物,一键搞定!写在前面 Emmm,转录组筛了十来个基因,想着扩大材料看看表达模式是否与数据体现相符,于是需要设计一下qPCR引物。当然,自然是有一些软件可以使用,但用起来不太方便。至少问了...
老师好,找到多胞后,怎么去掉呢?
DoubletFinder相信各位做单细胞的童鞋们,都遇到过去除多细胞的情况,而Cellranger默认的是前1%(3000cell),对于低质量的细胞有了算法来确认是否保留,但是对于多细胞而言,Ce...
请问一下,输出结果中有些null的,例如 Loupe Cell Browser file,这是为什么啊,对后续分析会有影响吗?
cellranger更新到6.0啦(全新使用教程)cellranger是10X GENOMICS单细胞上游分析的软件,主要有4个流程 mkfastq、定量 count、组合 aggr、reanalyze。如果是bcl原始测序...
刘小泽写于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...
您好,请问一下植物的gff3文件不标准,做出来的txdb不能用怎么解决呀?谢谢!
学习一遍ChIPseeker的使用刘小泽写于2020.5.23-24Y叔的原文在:https://mp.weixin.qq.com/s/3CMj0xejiV-FSMC-Vxd_-w 0 ChIPseeker的...
请问博主文中用的数据是在哪下载的呀?
deepTools 的使用(一)官方参考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下载安装 python ...
官方参考 https://deeptools.readthedocs.io/en/develop/content/installation.html 下载安装 python ...
使用genomicfeatures来构建txdb对象,首先就是安装对应的包 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TR...
楼主好,我根据您的方法把第一列都改成了“chr+数字”,但是后面依然报错,请问您知道怎么回事吗?
R: Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for functi...第1次用ChIPseeker就遇到了这样的问题: 然后上网也没找到对应的解决方法,无奈只好看manual,试了example也没问题,然后看到peak构造的时候,seqnam...