十月文献阅读记录 文献阅读一 Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a...

得到测序文件进行比对后经常需要对bam文件进行覆盖深度、靶向捕获效率的统计分析进行初步质控。这里介绍一个输出结果比较多的软件bamdst，bam...

首先，使用ALLbio软件下的breakdancer2vcf.py转化breakdancer得到的out文件GitHub地址：这里代码如下： 复...

CREST安装 CREST是基于Split Read原理对SV结构变异进行检测的一个软件。Github地址：https://github.com...

小的Indel（Insertion 和 Deletion），指的是在基因组的某个位置上所发生的小片段序列的插入或者删除，其长度通常在50bp以下...

对于高通量测序后的文件要进行质控QC有多个软件可以完成，包括最开始的fastqc以及对sam/bam文件的质控如：samtools、mosdep...

在服务器上经常遇到需要安装某个软件包的时候发现需要root权限才可以执行编译以进行安装。那么除了向管理员申请superuser的权限这样比较麻烦...