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    基于Vcf文件进行基因单倍型分析

    单倍型,是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称,在遗传学上是指...

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    R绘图|pheatmap热图绘制——高阶篇

    绘图场景:在高通量检测数据中,我们在数据展示上往往都喜欢将感兴趣的功能或者通路基因绘制成热图形式,能够让读者一目了然的发现某功能是增强了?还是减弱了?在实际过程中,表型实验上...

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    运用 R语言 pheatmap 包绘制热图进阶部分

    pheatmap包来显示行或列的分组信息 行或列的分组注释信息 在EXCEL中整理好样本和物种的注释信息,当然这个需要依据你的具体需求来确定。 对样本的注释信息,比如这里用到...

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    R绘制热图(pheatmap)

    热图可以反应各个样本的基因分布情况,把数字转换成图片更直观一些,目前画热图的软件不少,比如graphpad,华科也出了一款软件,甚至excel都可以,还有很多在线热图工具,但...

  • 使用GEMMA进行GWAS分析

    GEMMA(Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm)是一款基于混合线性模型的GWAS分析软件。相比较...

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    用ropls进行代谢组PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析

    简介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是对变量数超过样本数量或变量之间存在多重共线性的组学数据进行可视化、回归、分类和特征选择的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...

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    R绘图_热图包pheatmap

    pheatmap,全称Pretty Heatmaps,直译“完美的热图”,是一款非常优秀的热图绘制R包。网上也有很多可供参考的教程[1][2],在初学R后,我也曾写过了一篇教...