转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析等image 无参考转录组序列...
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无参转录组序列组装 — Trinity -
零基础教程 | 我有一堆基因，如何预测TF-Gene调控网络？写在前面 早晨起来，想起来很久很久以前，有一个用户提出的优化想法，觉得确实也合理，就更新了一下。顺便也把相关插件使用详细捋捋，方便大伙搞清楚这些插件都拿来干啥。早前，顺手写了...
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被子植物系统发育位置 杂记
被子植物中，无油樟目（Amborellales）、睡莲目（Nymphaeales）和木兰藤目（Austrobaileyales）并称基部被子植物类群，取首字母组合成了ANA ...
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被子植物系统发育位置 杂记被子植物中，无油樟目（Amborellales）、睡莲目（Nymphaeales）和木兰藤目（Austrobaileyales）并称基部被子植物类群，取首字母组合成了ANA ...
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TBtools基因家族分析详细教程（1）写在前面：非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具，作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义，课程购买地址，讲的很棒，可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
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文献阅读-三个Myb类的转录因子参与花粉管接收的过程本次阅读的文献，13年发表在《current biology》上的《Three MYB Transcription Factors Control Pollen Tube...
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全基因组复制 WGD |（一）简介
01 什么是全基因组复制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/复制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因组内的所有序列都发生重复，...
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采用生物信息学方法筛选和分析白癜风差异表达基因【2】
承接上一篇：采用生物信息学方法筛选和分析白癜风差异表达基因【1】 一、对象与方法 1．基因数据集分析： 从GEO数据库（http：//www.ncbi.nlm.nih.gov...
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群体遗传分析—LD连锁不平衡本文转载于百迈克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群体遗传学研究中，LD连锁不平衡分析是最常见的分析内容，也是关联分析的...
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【群体遗传】选择信号分析-Fst、Pi1.选择信号分析—Fst选择信号分析 概念 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群...
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0基础看懂转录组分析结果及后续数据应用人非生而知之者，无论是生活中还是科研中都会遇到各种陌生事物和难题，比如这种： 或者是这样的： 此时你的心情可能是这样的： 做科研的时候碰到了这种难题，又没有系统指导的话，很可...
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使用MEGA7利用NJ法构建系统发育树的简单小例子~视频版录制了视频介绍了使用MEGA7利用NJ法构建系统发育树的简单小例子，欢迎大家留言讨论，有帮助的话记得三连啊！这次一定 https://www.bilibili.com/vid...
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跟着Nature Genetics学数据分析~SNP数据计算距离矩阵然后构建NJ树最近在看论文 Phased diploid genome assemblies and pan-genomes provide insights into the genet...
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SNP/InDel变异注释解释
当SNP/InDel calling完后，会采用annovar、SNPEFF、VEF等软件进行基因位置、数据库等的注释。 一些关键的致病的注释解释：1.splicing ...
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基于的ssr 遗传多样性分析NOTE 基于种群聚类,特有等位基因 基本概念 1 多态性条带 个人理解就是ssr引物1 在位点 扩增出的 a b 2个条带（2倍体），ab长度可能相同也可能不相同。如果a条...
