一顾倾人城， 再顾倾人国
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试试BWA-MEM2 新的算法比对 速度提升很大很大
WGS分析笔记（2）—— bwa vs bowtie2
更新于2020.10.29 在进行正式的mapping记录之前，先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对于WGS结果的mapping，一般推荐...
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西北农林科技大学食品研究生
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我是外科医生，所以很粗暴的哟！～～<br>欢迎大家关注微博“医学小蛋散”哦～<br>让学医快乐～ <br>记录行医之旅～
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北京基因组所研究生在读，实验&生信小蜗牛一只。欢迎一起讨论呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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最近不常登陆简书，若评论问题没有及时回复，可以发邮件交流 bioinfortime@163.com
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Sanger 测序，NGS 测序，数据分析
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华中科技大学同济医学院<br>在读博士
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珠江医院肿瘤科简书号，同时也欢迎大家关注我们的微信号！
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博士在读，我会加油
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MutSigCV进行突变负荷分析寻找Driver Gene
本文的安装方法是有Matlab授权，运行MutSig源代码的方法。 如果没有Matlab授权，可以 http://www.mathworks.com/products/com...
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Bioinfo修炼中~<br>公众号 “生信OOP” ，欢迎关注！
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没有课题经费的话，自己出钱的，预算5000的话，组装一个电脑，推荐AMD R5 3600处理器(6核12线程），32G内存起步（hisat2虽然对内存要求不高，大概一个进程需要4g内存，但是其他比对软件比如STAR软件至少需要32G内存，才能很好运行）。预算更高的可以换AMD R7 3700（8核16线程） 或者i7 9700（8核8线程）处理器等等。
RNA-seq(5):序列比对：Hisat2
比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...
