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    利用QTL-seq软件进行BSA定位分析

    最近逛Github,发现一个新出的BSA自动化流程,就叫QTL-seq[https://github.com/YuSugihara/QTL...

  • 一套比较简便的基因组组装流程V2.0

    之前写过 一套比较简便的基因组组装流程[https://www.jianshu.com/p/a736b1b4b188],时间快2年了,现在新技术...

    1.7 1923 0 11
  • 利用quickmerge对基因组组装的contig去重

    quickmerge是一个用来去除基因组组装中的重复的软件。 该软件没有单独的文章,是作为某个基因组组装中的衍生脚本。该基因组文章是 Impro...

  • 利用Juicer v2.0挂载染色体

    最近在搞基因组,前面contig的组装难度不大,用wtdbg2、raven、mecat2、flye等组装就可以了。 组装完毕后,contig挂载...

  • 利用masurca进行混合二、三代测序数据基因组组装

    现在组装新基因组,一般用pacbio的hifi测序模式进行olc组装+Hi-c辅助组装染色体就行了,但是我们实验室以前测了一些基因组是低覆盖度的...

    1.0 2928 0 10
  • 一套比较简便的基因组组装流程

    这套流程主要特点是消耗资源比较少,1G以内的基因组,内存不要低于128G,最好能搞到256G,但是再多对这套流程用不上,更大的基因组没有测试过。...

    2.8 7168 1 18
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    rnaflow 一个新的全自动RNA_Seq数据分析流程

    最近接了个帮学院其他老师分析水稻转录组的活,但是媳妇赶着毕业,要帮她搞文章和数据,没空干这个,自己虽然会分析转录组,但是一直没有实现自动...

    7.3 2035 0 26
  • 多线程将SRA文件转化为fastq.gz文件

    利用NCBI数据进行分析的时候,遇到的第二个问题就是如何将SRA文件转化为常用的fastq文件。 NCBI官方提供的SRAtoo...

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    利用aria2快速下载SRA数据

    SRA数据就不多说了,目前我遇到的问题是,学校网络不太行,怎么批量快速的下载? 时代久远,原来我是怎么获得大量的SRA下载地址已...

个人介绍
生物信息民工,真正的民工。你们会写软件、写流程,我都不会。