1 vConTACT2的安装 根据官网[https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact2/src/master/]的安装说明,采用推荐的C...
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Introduction GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个专注于基因组分类学的数据库,旨在提供高质量的细菌、古细菌、叶绿体和线粒体的分类信息...
@小周的万用胶囊 好的,谢谢
生信log6细菌全基因组建树|基于GTDB-KT抽单拷贝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建树前言 最近在跑一个很大的数据集,大概有3500条以上的基因序列,因为数量太大,跑树有点搞不定,特此来记录一下这个过程 超过3000个基因组iqtree直接跑断直接跑了iqtr...
上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法[https://www.jianshu.com/p/b6c4d3376bc9],也埋下一个小坑:复现文章里好看的树,现在过来填...
前言 最近在跑一个很大的数据集,大概有3500条以上的基因序列,因为数量太大,跑树有点搞不定,特此来记录一下这个过程 超过3000个基因组iqtree直接跑断直接跑了iqtr...
你好,我想问下,一步法和分步法抽出来的marker gene是一样的吗?应该都可以用与建树吧
生信log6细菌全基因组建树|基于GTDB-KT抽单拷贝蛋白序列-iqtree2 && fasttree建树前言 最近在跑一个很大的数据集,大概有3500条以上的基因序列,因为数量太大,跑树有点搞不定,特此来记录一下这个过程 超过3000个基因组iqtree直接跑断直接跑了iqtr...