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Python--列表序列练习--EMS员工管理系统一、EMS员工管理系统（Employee Manager System） 功能：1.查询--显示系统中的所有员工 2.添加--将员工添加到当前系统中 3.删除--将员工从系统...
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《Python基础教程(第3版)》PDF高清版《python基础教程第3版》PDF高清版 百度云资源，内涵教材源代码 作者：Magnus Lie Hetland著，袁国忠译 百度云链接：百度云盘 提取码：7r7o 编辑推...
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post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL...
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Linux及相关生信技能笔记
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转录组入门(6)： reads计数要求 实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考...
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RNA-seq练习 第二部分（基因组序列下载，注释文件下载，索引下载，比对，比对质控,HTseq-count计数，输出count矩阵文件）参考基因组下载有三大全文网站提供参考基因组下载，它们分别是：1.NCBI （https://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc）2.UCSC (http://h...
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Biostar学习笔记（4）GenBank, FASTA, FASTQ and download SRA files from NCBI
Sequence data formats 1. Common sequence data formats including GenBank, FASTA, FASTQ f...
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SRA数据(2)------SRA数据处理
上次分享我们通过两种方式下载得到了SRA数据，今天就开始对SRA进行处理（以SRR5489805为例）。SRA（Sequence ReadArchive）数据库是用于存储二代...
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转录组分析——三、sra转换成fastq一、背景知识 1、sra数据 sra数据是SRA数据库用于储存二代测序数据的原始数据的一种压缩格式，这种数据格式不能直接进行处理，需要转换成fastq才能进行质控以及去ada...
