WGCNA：加权基因共表达网络分析，简而言之，就是将基因划分为若干个模块，探究与表型数据与基因模块之间的相关关系，并找到模块中的核心基因。 适用于复杂的数据模式，推荐5组(或...
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WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗 -
【基因组学】使用StringTie+gffread鉴定基因的新转录本写在前面 转录组通常被用来寻找差异基因，但是有的时候我们想看一下已报道的基因是否存在可变剪切现象，即新转录本的挖掘，这个时候就需要利用StringTie+gffrea...
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gffcompare的使用说明参考文献：Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, StringTie ...
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转录组入门（7）：差异表达分析这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果，进...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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如何优雅地使用Sublime Text3Sublime Text：一款具有代码高亮、语法提示、自动完成且反应快速的编辑器软件，不仅具有华丽的界面，还支持插件扩展机制，用她来写代码，绝对是一种享受。相比于难于上手的V...
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基因组|测序数据质控篇前言： 一般测序下机数据会存在含N比例过大、测序质量较低的碱基数占比过高、含有duplication、序列污染等低质量reads,这些不合格的reads会影响后续的分析，所以...
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简单理解RNA-Seq今天就当一个小故事看吧，看了statQuest，感觉讲的很棒，于是分享给大家原版视频后台回复“RNAseq”🤒花花今天效率太低写不完推送，于是我从晚上10点半开始帮她，有点紧...
