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示例数据:GSE139324有63个samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1393241...
复现文章:Analyses of metastasis-associated genes in IDH wild-type glioma数据来源:GSE84465图1 数据筛...
看了好几个其他人的教程,只有你的能运行成功👍
大佬,geo单细胞数据给的很多都是raw,或者matrix 生信小白从第一步就卡住了😭
scCancer包是2020年 清华大学Jin Gu团队开发的一个专门用于分析肿瘤单细胞转录组的工具包。它集成了单细胞数据分析的基本流程(Seurat),增添若干适合肿瘤数据...
@e0cb837cd5b9 您好我面临一样的问题,只有filtered_feature_bc_matrix(~1w cells)数据,跑代码报错Barcode file mising. 请问您说的“把raw文件夹删除因为默认是有raw数据的”是指Barcode文件里混入了raw数据吗?要怎么删除这部分数据呢
scCancer包:自动分析肿瘤单细胞转录组利器scCancer包是2020年 清华大学Jin Gu团队开发的一个专门用于分析肿瘤单细胞转录组的工具包。它集成了单细胞数据分析的基本流程(Seurat),增添若干适合肿瘤数据...