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  • IQ-tree2构建系统发育树使用小结

    IQ-TREE是一款用于系统发育推断的高效软件(Efficient software for phylogenomic inference),其主要具有以下特点:1.高效的树...

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    SPAdes安装及运行

    SPAdes的安装: 源代码安装: 将文件夹解压缩到指定位置 进入文件所在目录查看安装情况 定义环境变量 在根目录下查看安装是否成功 SPAdes组装短序列基因组

  • 基因组组装----SPAdes(一)

    关于基因组组装的流程可以参考我的简书:https://www.jianshu.com/p/e02ecd537c83 前面介绍了SOAPdenovo2的使用,但是由于结果整体不...

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    基因组组装----SOAPdenovo2

    1.基因组组装的流程 基因组组装的大概流程如下: (1) 测序得到raw reads序列。 (2) Reads质量评估。 (3) 原始reads质控。 (4) 选择合适的参数...

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    Beast系统发育关系和分化时间的估算(上)

    以下内容参考了同研究组师弟整理的笔记、和网络资源:Beast v1.8简易手册-修订版 · 语雀 (yuque.com)[https://www.yuque.com/wush...

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    IQ-TREE最大似然法构建系统发育树的神器

    IQ-TREE:最大似然法构建精确、快速、灵活、广泛的系统发育树 IQ-TREE自2011年就已经开发并开源,至今都有专业团队维护,其名字来源于IQPNNI和TREE-PUZ...