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非常感谢作者详实的步骤👍👍👍🍸🍸🍸
一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)
之前写过一系列qiim2的教程都是零零散散的记录，里面也有不少命令打错的步骤给各位小伙伴造成了不少的疑惑，恰逢qiime2-2020.11发布，所以就在重新总结一次，这次稍后...
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6.7 特征表统计
time qiime feature-table summarize
--i-table table-rename.qza#otu_table-rename.qza嘛？
--o-visualization table.qzv
--m-sample-metadata-file sample-metadata.tsv
作者：R语言数据分析指南
链接：https://www.jianshu.com/p/725ee7a106b2
来源：简书
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。一文完不成qiime2微生物多样性分析(2021版上)
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6.4 R更改特征表名称
library(pacman)
pacman::p_load(tidyverse,magrittr,stringr)
otu <- "otu_table.tsv" %>%
read.delim(check.names = FALSE,header = T,sep="\t")
rown <- patse0("ASV",seq_len(nrow(otu)))#函数应为paste0，误写成patse了吧
otu[,1] <- rown
colnames(otu)[1] <- paste0("ASV",colnames(data)[1])
write.table (otu,file ="otu_table.tsv",sep ="\t",row.names = T,quote = F)#row.names = T应改为 row.names = F 吧
作者：R语言数据分析指南
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python: 整理Unicycler基因组组装结果
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