使用LazyGit来管理你的项目。 Git的强大是所有开发者都心知肚明的事情,但是其多样的命令令人很是难受。不过在Github上有着这么一个开源项目lazygit。 Lazy...
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本章导航: 1. 介绍 MPE。 2. 简要介绍几个十分好用的 MPE 的功能。 使用电脑环境:Windows10。本章主要参考 MPE 官方中文文档。 3.1 Markdo...
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重...
作者:童蒙编辑:angelica 一、介绍 Flye是用于单分子组装数据的denovo基因组装的软件。这个软件可以用于各种数据集,从小的细菌到大的哺乳动物。 输入是原始的Pa...
写在前面:在上亿年的进化历程中,基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比对可以通过比对序列中的同源区域...
LASTZ说明文档(v1.04.15, Aug27 2021 build)本文参考自LASTZ发行版[http://www.bx.psu.edu/~rsharris/last...
1. 医学事务部在公司的地位如何? 医药商业模式历经多次变化,从一开始的销售驱动,到后续的市场驱动,再至现在的医学驱动。医学驱动(medical driven)是在2015年...
GEO(GENE EXPRESSION OMNIBUS),https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/,由美国国立生物技术信息中心NCBI创建维护的,是...
挖掘公共单细胞数据集时,会遇到常见各种单细胞测序数据格式。现总结如下,方便自己日后调用,以创建Seurat对象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
作者:May审稿:童蒙编辑:amethyst 引言 大家好,又到了阿拉丁聊基因组的时间了。今天我们按照上期的计划,我们来聊一下基因组测序技术中的两大神兵利器之--Pacbio...
ggplot2基础(5)——配色与图例 参考《R数据可视化手册》、《R绘图:一文了解ggplot2颜色的设置[https://zhuanlan.zhihu.com/p/148...
有关步骤可以参考之前的2020-04-23 绘制Circos图之二 测序深度https://www.jianshu.com/p/ce76f043b45f[https://ww...
一、背景介绍 通常,BED文件的overlap/intersect的操作,可以BEDtools intersect功能完成overlap和统计:Bedtolols inter...
本文展示如何使用ggplot2包绘制测序reads深度分布图,即用条形图来展示每个位点的测序深度,以及用饼图来展示检出病原的分布。 作图数据说明 传递文件1“VM00986....