在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAV...
在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天为大家介绍在线分析工具的使用——DAV...
eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常见的方法就是BLAST+BLAST2GO, 或者...
目前,转录组测序仍是应用最广的高通量测序技术之一,很多研究课题是关于基因表达潜在的机制,并已经发现了一些现象,但分子机制还不清楚。而做转录组测序特别适合用于分子机制探究,可以...
https://www.pnas.org/content/116/8/3091#sec-1[https://www.pnas.org/content/116/8/3091#s...
比较基因组学中,共线性的分析的图无疑是很漂亮的。 共线性分析可以很好地解释进化关系和多倍化事件。上一篇介绍了怎么利用MCScanX来做共线性分析,虽然后面有java的包来支持...
导读 比较平均核酸一致性average nucleotide identity(ANI)和氨基酸一致性amino acid identity(AAI)是比较基因组常用的两种基...
安装使用 比对nr库 提速办法 亲测增加 --block-size 15 --index-chunks 1这两个参数后速度提升10倍以上。 参考:使用DIAMOND将全基因组...