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  • 统计fastq文件read长度及read平均长度

    转录组分析使用stringtie定量后,如果使用DESeq2进行下游分析,需要使用prepDE.py生成read counts矩阵,prepDE...

  • 修改stringtie、ballgown 结果中部分gene_id为ref_gene_id

    问题:stringtie组装转录本后会改变原本参考基因组注释文件中的gene_id stringtie 组装、merge的stringtie_m...

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    TaWRKY19 抑制TaNOX10表达,降低ROS反应,降低小麦条锈病抗性

    One-sentence summary:TaWRKY19 transcriptionally represses the expression...

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    根瘤菌tRF调节大豆结瘤

    作者发现根瘤菌中三个转运RNA产生的small RNA可以进入大豆根毛细胞,并结合AGO1降解植物中与根毛卷曲、根瘤菌侵染相关的5个基因的mRN...

  • 黄学辉老师报告记录

    全基因组关联分析在植物中面临的挑战:1、在自然群体中对复等位基因控制的性状进行分析有些困难2、难以定位群体中的稀有突变增加群体大小3、最大挑战:...

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    dN/dS (Ka/Ks) 原理及计算方法

    CONCEPTS In genetics, dN/dS also known asor Ka/Ks, is used to estimate t...

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    对26份大豆进行De Novo组装并构建大豆泛基因组

    1 Introduction Pan-genome 相比传统线性Reference genome具有的优点: 包含物种所有的基因,主要体现在可以...

  • 水稻蛋白质系统进化树构建方法

    利用最大似然法构建水稻蛋白系统进化树 1 蛋白序列获取 在MSU上检索蛋白序列,最终检索获取到770条蛋白序列。 2 多序列比对 利用CLUST...

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    作物遗传改良助力优美稻田“绿色减排”

    今年的4月22日是第50届世界地球日,庆祝主题为“Climate Action”。我国地球日宣传活动周的主题为“珍爱地球,人与自然和谐共生”。全...