请问RFMIX中用到的genetic map文件中的遗传距离列是直接通过变换物理位置得到的吗
群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
发简信
IP属地：北京
-
-
请问RFMIX中用到的genetic map文件是怎么制备的呢
2022-12-02 | 普遍渗入促进了牛属物种复杂的驯化和适应
●英文题目：《Pervasive introgression facilitated domestication and adaptation in the Bos spec...
-
2022-12-02 | 普遍渗入促进了牛属物种复杂的驯化和适应●英文题目：《Pervasive introgression facilitated domestication and adaptation in the Bos spec...
-
命运把你带到那里，那你就大大方方的去
-
-
-
@__Smile浅笑 需要设置时间的大小
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
-
根据经纬度获取气候因子 | Worldclim + ArcMap工具准备 ArcGIS Desktop下载安装 软件的下载和安装自行解决，可参考文末提供的参考资料。 Worldclim数据下载 可以从Worldclim官方网站上查找到历史...
-
使用R语言绘制热图：R包pheatmap的全参数详细介绍pheatmap参数： 网上有针对热图绘制的粗略讲解，但是都是参数不完整，可能不能满足所有人需求，于是手动整理了热图的全参数介绍。 mat 数组矩阵（要绘制热图的数据源，保证...
-
大佬请问，fastsimocal2可以正常运行，也可以输出.brent_lhoods和.bestlhoods文件，但是日志文件显示Simulations did not converge. MRCA not found! (2 lineages remaining)，存在一个bad.par文件。里面是最后以此模拟的参数，请问该怎么解决呀
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
-
您好，请问您解决了吗
fastsimcoal2推断群体演化历史(Demographic history)
1. 群体演化历史分析的案例： 群体演化包括有效群体大小(Ne)变化、基因流，迁徙，分化等，会对等位基因频率产生显著影响，塑造了现有遗传多样性的模式和水平。群体演化、遗传漂变...
-
bedtools----getfasta
getfasta可以根据BED/GFF/VCF文件提供的feature在染色体上的位置信息，从fasta中提取feature的碱基序列 bedtools getfasta [...
-
您好，请问如果vcf文件中不只包括您提到的四种基因型时（比如说0/2），我可以直接在脚本中自己进行定义修改吗
基于Vcf文件进行基因单倍型分析
单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称，在遗传学上是指...
-
学习笔记<br>研究方向: 植物群体遗传学<br>
-
请问您解决了吗
基于Vcf文件进行基因单倍型分析
单倍型，是单倍体[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的简称，在遗传学上是指...
-
@DumplingLucky 请问大佬，有NA的话怎么处理呀
Treemix检测杂交事件
treemix由Joseph K. Pickrell和Jonathan K. Pritchard开发，文章Inference of population splits and...
-
在线画图平台千千万，总有一款适合你人人都想画出好看的图来展示成果，如果你没有编程基础，各大公司的云平台基本可以满足大部分需求或者找人帮忙，如果你是大牛，可以自己写个小工具个性化定制。如果你懂一点想学习更多自己...
-
@dowaves 您好，请问您的问题解决了吗？想请教下
structure图绘制(三)----structure图的绘制
如何用经过格式转换形成的bed,bim,fam格式的文件绘制简单的structure图呢？下面将开始介绍admixtrue软件的使用以及如何用输出的结果在R中绘图。 1.ad...
-
您好，请问您的问题解决了吗？想请教下
GWAS 学习之admixture
背景 群体遗传学中测出很多个个体，得到了最终的SNP vcf文件，需要将其分成群体，看哪几个物种聚在一起。一般使用的软件就是STRUCTURE，但是STREUTURE运行速度...
