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    人鼠基因转换

    背景: 由于人和小鼠研究进展差异,人类基因功能/注释研究会更加深入,一些数据库只有人的注释。又或者研究中通常采用小鼠模型进行验证,这种情况下就会涉及一些基因 name / i...

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    R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图

    我们在做表达谱数据分析的时候,经常需要检测基因两两之间表达的相关性。特别是在构建ceRNA网络的时候,我们需要去检查构成一对ceRNA的mRNA和lncRNA之间的表达是否呈...

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    lncRNA,miRNA,mRNA互作

    通过lncRNA获得结合的miRNA(3个miRNA预测数据库中都存在),再获得miRNA作用的靶基因mRNA,靶基因mRNA与任一肿瘤差异mRNA取交集,交集mRNA与其相...

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    【转载整合】RNAseq data的network analysis的不同做法,原理和方案

    网络:其实就是“图”,由点(node)和边(edge)组成一般来讲,探索基因表达数据的标准流程是这样: 差异表达分析: 研究转录水平不同处理的差别的原因 基因富集分析 (GO...