华中农业大学<br>园艺植物生物学教育部重点实验室
IP属地：湖北
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基因家族扩张或收缩（未完待续）基因家族扩张或收缩，进化树1[https://www.jianshu.com/p/8c6ef557cc71?from=singlemessage] 2[https://ww...
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SCAU课堂 | 「比较基因组分析」专用 Docker 镜像写在前面 没想到，上个选修课，准备示例数据和镜像上，竟然花了我三四天....主要原因还是，「网速太差」。搞七搞八，终于搞定。尽管整完之后，我其实担心学生拿到这个使用文档也不知...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
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BLAST数据库构建过程中sseqid无法关联到staxids的问题blast本地数据库构建已经是一个很繁琐的事情了，比对NT或NR数据库还是会遇到各种问题：废话少说，先记录一下本地构建BLAST数据库： 下载安装BLAST+的过程，并添加环...
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PASA（2.4.1）使用记录
文章仅是记录自己的学习使用，有错误请指出，我立刻改正！ 官方说明：https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/wiki[http...
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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「生信」基因组功能注释后的基因筛选目录写在前面功能注释数据库介绍方法一: 以KEGG的注释结果为主, 筛选出每个品种包含的特异通路及基因方法二: 利用pfam的注释结果, 过滤掉每个品种具有相同结构域的基因,...
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宏基因组功能注释（以COG为例）Contigs/Scaffolds序列经基因预测、ORF开放阅读框识别（Open Reading fr ame）和蛋白翻译之后，就可以进行功能注释分析了。我们将基因/蛋白序列...
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