该如何自学入门生物信息学 （很好的入门指导，生信小白免走弯路）生信宝典，原文链接解螺旋的矿工，Cell哥呕心力作，授权转载。文后更多阅读课帮助实践黄兄提供的学习思路。 前几天...
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该如何自学入门生物信息学-（很好的入门指导）
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scRNAseq双细胞去除-1: DoubletFinder10x平台的双细胞率（符合泊松分布1）： 根据Poisson分布，单个液滴包含超过一个细胞（doublets或multiplets）的频率随着上机细胞的浓度而改变。通常如果上...
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（笔记）单细胞数据分析1：DoubletFinder 去除双细胞参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/469335625 1. DoubletFinder概述 单细胞测序期望每个barcode标签下只有一个真实的细...
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DoubletFinder
相信各位做单细胞的童鞋们，都遇到过去除多细胞的情况，而Cellranger默认的是前1%（3000cell），对于低质量的细胞有了算法来确认是否保留，但是对于多细胞而言，Ce...
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ggplot2画图一些不常用但是很重要的画图参数一、调节顺序 有的时候我们需要调节x轴，y轴或者图例的标签顺序，这个时候当然方法不知一种，我们这里写一种常用的方法供大家参考： 二、特定的线段加箭头 三、添加标签 四、添加特...
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单细胞转录组之Seurat包全流程-数据过滤、降维分群及可视化1.Seurat包的安装及数据的准备 1.1 加载需要的包和数据 1.2 创建Seurat对象 对于之前从CellRanger得到的比对结果，读取sample/outs/fi...
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课程会在2019年9月底之前录制完毕并上线： 课程说明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代码在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 观看链接 手机微信观看（推荐）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 电脑浏览器的链接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
