• @Wei_Sun 十分感谢,终于找到定位区间

    1.QTL定位:Rqtl—— Single-QTL analysis

    R/qtl是一个可扩展的、交互的、用于QTL定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的QTL定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。 官网:https://r...

  • @Wei_Sun 还想再请教一下,如果想自己划定阈值,比0.2和0.05计算得出的值会高一些,缩小定位的范围,请问应该输入什么代码获得自定阈值得到的定位位点呢

    1.QTL定位:Rqtl—— Single-QTL analysis

    R/qtl是一个可扩展的、交互的、用于QTL定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的QTL定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。 官网:https://r...

  • @Wei_Sun感谢解答,我的SNP数量太大,需要先用R转置,这样在第二行第一列会出现NA,可能是这个的原因

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  • 您好,请问导入数据出现(EError in read.cross.csv(dir, file, na.strings, genotypes, estimate.map, :
    You must include at least one phenotype (e.g., an index). There was this value in the first column of the second row 'NA' where was supposed to be nothing.)这样的问题是为什么呢,我检查了文件格式,和示例数据的格式是一样的,但是表型的标题和具体数据中间是NA不是空格,这个影响吗

    1.QTL定位:Rqtl—— Single-QTL analysis

    R/qtl是一个可扩展的、交互的、用于QTL定位的R包,集数据分析和绘图于一体。特点是使复杂的QTL定位方法被广泛使用,使用户专注于建模而不是计算。 官网:https://r...