多组学研究思路以及写作 非生物胁迫 类型干旱胁迫、盐胁迫、低温胁迫、高光/UV-B胁迫、高温、重金属、机械损伤、营养缺乏等 影响地理分布、产量、粮食安全 大牛朱健康、巩志忠、...
多组学研究思路以及写作 非生物胁迫 类型干旱胁迫、盐胁迫、低温胁迫、高光/UV-B胁迫、高温、重金属、机械损伤、营养缺乏等 影响地理分布、产量、粮食安全 大牛朱健康、巩志忠、...
1.预测理化性质:分子量(Da)、等电点(PI)\不稳定系数(Instability index)、亲水指数(Grand average of hydropathicity-...
人民日报:研究生期间该懂的47件事 原文转自人民日报【研究生期间该懂的那些事】①阅读文献,尽量深地了解研究领域;②如果英文尚未精通,暂且不要学二外;③不要期待导师给你太多指导...
谢谢
PSORT--蛋白质亚细胞定位预测1、分析蛋白质的亚细胞定位有助于了解:蛋白质功能和蛋白质互作生物体细胞器类型:细胞核蛋白质、线粒体蛋白质、内质网蛋白质、细胞膜、叶绿体蛋白质、高尔基体2、通过生物信息学在线分...
例如你的图片就是定位到plas吗?
PSORT--蛋白质亚细胞定位预测1、分析蛋白质的亚细胞定位有助于了解:蛋白质功能和蛋白质互作生物体细胞器类型:细胞核蛋白质、线粒体蛋白质、内质网蛋白质、细胞膜、叶绿体蛋白质、高尔基体2、通过生物信息学在线分...
你好,请问这个结果怎么看呢
PSORT--蛋白质亚细胞定位预测1、分析蛋白质的亚细胞定位有助于了解:蛋白质功能和蛋白质互作生物体细胞器类型:细胞核蛋白质、线粒体蛋白质、内质网蛋白质、细胞膜、叶绿体蛋白质、高尔基体2、通过生物信息学在线分...
你好,请问这个结果分数具体怎么看呢
WoLF PSORT——亚细胞定位在蛋白质分析中,不可避免的需要考虑其在细胞中的位置,为其功能的鉴定和分类奠定基础,下面将讲述如何利用在线方式来进行subcellular localization. 1.首...
写在前面:首先这是一门售价为 0.01 元的视频课,应该买不了吃亏和上当哈~而且和我本人没有任何关系,单纯觉得还蛮有用,推荐一下哈~ 具体课程目录举例见下图,都是基础中的基础...
棒棒哒
基因家族生信分析基础,基础到教你序列下载的那种基础!(一)写在前面:首先这是一门售价为 0.01 元的视频课,应该买不了吃亏和上当哈~而且和我本人没有任何关系,单纯觉得还蛮有用,推荐一下哈~ 具体课程目录举例见下图,都是基础中的基础...
我在重复做WRKY基因家族分析的时候hmmsearch搜索后,想建立特异模型,问题是:提取一条domain和提取两条domain有区别吗
基因家族鉴定与分析关于基因家族鉴定及表达分析步骤,包括数据的获取,软件的使用,步骤流程。需要批量的重复步骤可使用脚本来完成。 1.1 此页面下载 hmm文件 1.2 blastp 比对鉴定...
你好,请问如果一个基因家族有多个domain,在构建hmm特异模型的时候,只提取一个domain还是提取两个domain?
基因家族鉴定与分析关于基因家族鉴定及表达分析步骤,包括数据的获取,软件的使用,步骤流程。需要批量的重复步骤可使用脚本来完成。 1.1 此页面下载 hmm文件 1.2 blastp 比对鉴定...
你好,请问在构建目标物种基因家族的hmm模型时,使用的是NBS所有的domain序列还是其中一个呢?
基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型&同源blast)方法一:基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件:ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
刘小泽写于18.9.25今天接触到一个新名词——基因家族分析,不搜不知道,一搜吓一跳。2018年关于基因家族分析的文章已经超过了180篇,并且门槛不高,甚至用公共数据库就能做...
本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的,还有就是生物信息学方面的,总而言之,言而总之,希望能够帮助到大家。 关键词:生物信息学工具;绘图工具 1、itol用于对系统进化...
核酸数据库 NCBI [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/]NCBI (National Center for Biotechnolo...
作者你好,我在使用三大数据库的时候,我应该选择他们的并集还是交集呢?例如,我有100条序列,使用SMART搜索时出现四个未查询到(例如是1234);使用CDD都查询到了;使用PFAM只有一个没查询到(假如是5)?
基因家族专题(3):基因家族成员的鉴定Data preparation 继续上次的内容,下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下,下载好的数据。 基因组序列信息,存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...