IP属地：香港
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随笔 | 研究生阶段如何“摸鱼”？
昨天，把吴老师和小朋友和小朋友送上回贵阳的飞机。分别一刻，还是有点感触。不知是年龄所致，还是如何原因，我最近似乎更偏向感性。毕竟也在公众场合，只好拿起手机，刷一刷以作掩饰。地...
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这，杀敌一千自损八百啊！
随笔 | 教你四招，把你的导师「虐哭」！
很多时候，我们会发现导师非常可恶！于是，把他们虐到哭的想法就油然新生。我之前是研究生，现在是导师，具有从两个角度看到同一场景的能力，战斗经验异常丰富。今天突发奇想，将「毕生所...
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Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
1、eQTL、mQTL共定位分析的作用 eQTL、mQTL共定位分析属于Post-GWAS的一项重要工作，旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关的eQTL和mQTL位点。 传...
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基因组重复序列检测：RepeatMasker的安装及使用RepeatMasker是重复序列检测的常用工具，通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列，属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
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bioinfo100-第23题-转录组的比对与基因组的比对有何不同？参考： 孟浩巍的知乎zhn 第23题 转录组的比对与基因组的比对有何不同？ Hello大家好！我们今天又见面了！ 我们通过前期的22个问题，从数据的简单质控，到测序数据的ma...
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RADAR这个网站大家都可以进去吗？
RNA编辑：相关数据库和分析软件REDItools
数据库： 1.DARNED：https://darned.ucc.ie/包含大约42000个人类基因组坐标的信息。 2.RADAR：http://rnaedit.com/包含...
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target数据库初探在简书上看了很多文章，有很多收获，但自己从来没写过。 生信有很久没碰了，因为需要，又一次捡了起来。 之前在TCGA数据库一直没有找到骨肉瘤的临床数据，不能把基因表达和临床预后...
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GWAS - 基因型与表型的关联分析流程这里介绍的SNP数据与单一表型的相关分析流程 一、准备plink文件 ped和map文件转换为bed、fam、bim mydata为ped和map的文件名，不需要加后缀mak...
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SNP功能注释网站合集这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后，优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后，请坚持看完 1、GWAS4D, 推荐指数：**** 网址：htt...
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Reditools-RNA-editing
最近在做RNA-editing，纵观文献综述，相关软件很多，但是属reditools独领风骚。不过还是想吐槽一下这个软件，软件是好软件，就是文档写的也太不认真了吧。。 今天先...
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RNA编辑：相关数据库和分析软件REDItools数据库： 1.DARNED：https://darned.ucc.ie/包含大约42000个人类基因组坐标的信息。 2.RADAR：http://rnaedit.com/包含...
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miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】该教程分为2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw reads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】 因为之前碰到...
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TCGA数据下载和整理的三种方法TCGA数据下载方法：gdc-client，Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息（样本）：（存储单个病人表达数据，需整理为表达矩阵） + （存储样本文件的...
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Matrix eQTL分析目前针对QTL分析有很多软件，比如Plink、 Merlin、R/qtl、FastMap等等,今天给大家分享一下如何使用Matrix eQTL进行分析。首先我们先了解一下什么...
