蛋白质都是由相似的小型结构域组成的。如果我们有若干个已知的蛋白序列,那我们就可以根据这些蛋白序列比较其含有的保守域,寻找在蛋白数据库中上是否也有一样保守域的蛋白。而后根据统计...
一、获取SRA号 登陆Genome Announcements网站(地址:https://mra.asm.org/[https://mra.asm.org/]),搜索感兴趣的...
现在的第三代测序技术中,主要以PacBio公司的SMRT和Oxford的Nanopore技术为主。与前面的两代技术比较,第三代最主要的特点在于单分子测序,就是测序的过程无需进...
CCS: Generate Highly Accurate Single-Molecule Consensus Reads Latest ccs can be install...
在分析高通量测序数据的时候,我们会对Q20/Q30不陌生。那么Q20/Q30是什么意思呢?又是怎么来的呢? Q20,Q30它们代表的是某一碱基质量值占全部碱基数的百分比,就类...
(一)LeNet神经网络 这个网络是远古时期的网络了,出自美国八十年代。当时为了解决的是支票或者邮件编码的识别问题。也就是MNIST手写数字识别的起源来源。 我们可以看看它具...
最近要做一个京东账号相关的项目,京东的密码支持字母、数字、和符号,字母和数字都好做,正则匹配a-zA-Z0-9就可以搞定了,要匹配所有英文符号的话,找了一圈也没有找到合适的方...
说在前头 啥是kmer? kmer就是一条长度为kbp的DNA string。 Jellyfish有啥用? 计算输入的基因组数据(fasta)、测序数据(fastq)等,长度...
2021.3.9持续更新中。。。主要参考:生信曲线[https://www.bilibili.com/video/BV1oa4y1H7CU?t=31]、基因学苑[https:...
Clip 的含义: Clip 作为名词讲,有剪下来的东西的意义,在SAM/BAM 比对文件里面,用于描述那些一条序列上,在序列两端,比对不上的碱基序列(还是很形象的,一条上比...
写在前面的废话 有时候我在读文献时,明明前面用的是alignment,但是接下来又使用了mapping。起初,我认为二者意思相同,后来发现没那么简单。无奈之下只能自己搜集资料...