@Sweetheart_483a rawdata 里面的manifest删了再跑—来自庄小尽
TCGA 拷贝数变异（CNV）数据整理（一）zhuang_gj 3月-09-2021 从TCGA下载Masked Copy Number Segment 数据-----解压后进行处理 marker file数据下载和处...
IP属地：湖南
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@李坤二 https://github.com/ShixiangWang/install_GISTIC/blob/master/preprocess.R
这里有去除重复的方法TCGA 拷贝数变异（CNV）分析
背景 查看某些基因在特定癌症里是不是发生了拷贝数变异。 最简单的方法 直接去一些分析网站上查看，当然也有一些弊端，例如数据更新滞后，没有给出明确的分析方法和判断标准等，心中不...
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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TCGA 拷贝数变异（CNV）–使用maftools读取和汇总gistic输出文件（三）读取和汇总gistic输出文件 maftools : Summarize, Analyze and Visualize MAF Files[https://rdrr.io/b...
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TCGA 拷贝数变异（CNV）数据整理（一）
zhuang_gj 3月-09-2021 从TCGA下载Masked Copy Number Segment 数据-----解压后进行处理 marker file数据下载和处...
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@庄小尽 我按照您这系列的下一集，把文件上传后在线分析，最后只得到
gistic_inputs.mat
stdout.txt
这两个文件，其他的都没有，不知道是哪里的问题😭
老师您可以帮忙分析下原因吗？不胜感谢TCGA 拷贝数变异（CNV）数据整理（一）
zhuang_gj 3月-09-2021 从TCGA下载Masked Copy Number Segment 数据-----解压后进行处理 marker file数据下载和处...
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老师好，我在第一步整理TXT文件到一个文件夹时，您的示例是
## [[1]]
## [1] FALSE
##
## [[2]]
## [1] FALSE
我的是
[[1]]
[1] TRUE
[[2]]
[1] TRUE
想问下是哪里出了问题？谢谢！TCGA 拷贝数变异（CNV）数据整理（一）
zhuang_gj 3月-09-2021 从TCGA下载Masked Copy Number Segment 数据-----解压后进行处理 marker file数据下载和处...
