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多基因风险评分是一个用来评估个体患某种疾病风险的方法，它是通过GWAS统计数据的基因型效应值来计算的。计算公式如下： n: 纳入的SNP的数量；Xi：SNP I的基因型（0，...

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前言 认识文件名，这玩意太重要了！行外人看不懂啊！！！！！！ 高逼格的东西自己阅读参考文件了，我只上最粗暴的！～ 尼马的，给我记好了，不然在GWAS分析的路上活不下的！！！ ...

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前言 你以为，曼哈顿图之前的数据， 天都会给你准备好？ 实际是，你去曼哈顿前，都起码买张机票吧？ 这文章重点不在作图，作图可以参考其他大神的文章（会列举在最下面～） 本节谈谈...

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1、基本统计学概念 假设检验• 零假设(H0):即原假设• 备择假设(H1):与零假设对立的假设• 计算零假设(H0)成立的概率• 如果H0成立的概率很低(e.g. 5% o...

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这篇文章是对SNP位点功能注释在线网站的一个总结帖。 软件排名不分先后，优先顺序可以看推荐指数。 彩蛋在最后，请坚持看完 1、GWAS4D, 推荐指数：**** 网址：htt...

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老规矩，还是资料整理者，边学习边做笔记，可能会改动原文章，按自己的理解将多篇优秀的推文自由整合，后面会附上所有引用推文的出处，感谢各位作者！ 先说说PRS是用来干什么的？ T...

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miRNA是非编码调控小分子，通过抑制基因表达发挥作用，前体pri-miRNA、pre-miRNA通过核内的drosa酶作用，由核孔复合体进入至胞浆中，在通过Dicer酶的剪...

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1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些数据？ TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项目始于2005年，它旨在使用基因测序和生物信息学编目与癌...

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正常来讲，看懂以下图片，就已经可以明了关于miRNA命名的大部分问题了。 （图片来源于网络，链接已迷失~~~） 以下内容选自miRBase命名法说明，翻译不当，敬请谅解。 W...

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在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清晰地展现出来，不少读者朋友应该...

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最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈推荐百迈客云课堂课程GWAS生...