发简信
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知乎@黄小伟Yeah｜专栏：中国R语言社区<br>公众号：表哥有话讲、R语言中文社区
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宏基因组数据分析流程代码熊金波实验室出品 整理归纳：Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下： 地址：gs0.genek.tv 用户名：u3276 密码：genek.tv（建议...
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R包table1创建网页格式的描述性统计表Table 1
介绍 例1 例2 使用缩写代码指定自定义renderer 显示不同变量的不同统计信息 改变表的外观 - 使用内置的样式 p-values列 表格的转置 介绍 在流行病学和其相...
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PlantCV 中文教程（2）
安装配置 最低配置需求： PlantCV 在以下系统已测试: Linux: CentOS 7 (RedHat Enterprise Linux) Linux: Ubuntu ...
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公众号：青柠学术。分享优质的科研技巧、效率工具。
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周运来，男，长大了才会遇到的帅哥，稳健，潇洒，大方，靠谱。一段生信缘，一棵技能树。生信技能树核心成员，单细胞天地供稿人，简书创作者，单细胞数据科学家。
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. 201...
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公众号：“生信补给站”<br>生物信息学 R语言 Python语言
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ggstatsplot绘图|统计+可视化，学术科研神器
本文首发于“生信补给站”公众号，https://mp.weixin.qq.com/s/zdSit97SOEpbnR18ARzixw更多关于R语言，ggplot2绘图，生信分析...
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不做无条件咨询，见谅
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[R] 如何快速生成许多差异明显的颜色？这个需求真的太常见了！注意问题强调的几个关键词：一是快速，二是大量，三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本，比如宏基因组中的物种分析： 方法一：自定义 自定义...
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
