前言 在前面的一系列WGS文章中，我讲述了很多基因数据分析的来龙去脉，虽然许多同学觉得很有帮助，但是却缺了一个重要的环节——没有提供实际可用的数据来实战完成具体的流程，不能得...
IP属地：内蒙古
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GATK4.0和全基因组数据分析实践（上） -
bwa+samtools+picardtools+GATK call SNP 流程call SNP GATK bwa+samtools 参考文档 一、原始数据处理 测序得到的RAW DATA，使用NGSQCToolkit进行过滤$PATH/Il...
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GATK4.1 call SNP
GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同，更加趋于流程化。 软件安装 点击此处 查看最新版本 GATK 简单说明 GATK分析简要流程 所需数据 ref.fa rea...
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分子生物学 | 原核生物基因表达调控基因表达的调控 基因表达(gene expression)是指储存遗传信息的核酸序列经过一系列步骤表现出其生物功能的整个过程 基因表达包括： ①基因经转录、翻译产生有生物活性...
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全基因组重测序流程【超细致！！】
自己在研究生的第一个项目就是处理重测序数据，在做的过程中参考了很多资料，现在把整个重测序的上游分析流程分享给大家，一些关键环节已经帮大家踩过坑了，相信跟着学习实践一定能够收获...
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GWAS | 遗传力计算
遗传力又称遗传率，指遗传方差在总方差（表型方差）中所占的比值，可以作为杂种后代进行选择的一个指标。遗传力分为单株遗传力、家系遗传力、小区遗传力、个体遗传力。动物中一般用个体遗...
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一文总结：双荧光素酶实验的原理、应用及详细步骤想验证miRNA与靶基因的作用? ——双萤光素酶报告基因检测 想了解miRNA和lncRNA/circRNA的靶向互作?——双萤光素酶报告基因检测 想知道转录因子对下游基因的...
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数据挖掘中的LogFC,p值和FDR值是什么？GEO数据挖掘或转录组分析差异表达[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因时，结果中...
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生信笔记5-GWAS与eQTL引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析（Genome Wide Association ...
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没用过这个，估计也是编码不一样
R脚本打开乱码就这么办
别人分享的R脚本，打开，想看注释理解下，结果全是乱码，，，， 怎么办？？？ 搜索了下常规修改方法，file-tools-code-UTF8，并没有变化； 又找了一篇，发现正解...
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求博主，R加载不了shoemaker2015数据，提示不存在这个数据
RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一）
RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一） 小鱼爸 2023-07-12 简介 了解基因表达的时序动态变化是生物学的一个基本问题。此教程提供了多时间点数据的分步实战...
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ggplot2优雅的修改图例形状本节来介绍如何更改图例中键的形状，每个 geom 都有一个默认的 key_glyph，但可以通过在 geom 调用中声明 key_glyph="code_here" 来修改它...
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主成分分析-PCA图的优化（R语言）
R语言的主成分分析（PCA）详解和带聚类的PCA图绘制 最近有个老师在整理文章数据，由于分组较多，想展示PCA图，说明不同分组的差异，公司默认给出的PCA图比较朴素，想做的好...
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RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一）RNA-Seq 分析流程：多时间点样本分析实战（一） 小鱼爸 2023-07-12 简介 了解基因表达的时序动态变化是生物学的一个基本问题。此教程提供了多时间点数据的分步实战...
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写国自然缺素材？来篇55分的综述帮你总结lncRNAs的基因调控及其生物学功能
尽管lncRNA作为单点创新已经没有那么充分，但是lncRNA与其他热点的交叉方向依旧是国自然中标热门。你的国自然标书是不是还需要一些lncRNA的素材？ 今天小编分享的这篇...
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RNA-protein 相互作用数据库-catRAPID今天给大家分享的是如何使用catRAPID数据库来进行RNA-蛋白的相互作用预测。数据库网址：http://s.tartaglialab.com/page/catrapid_...
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lncRNA研究思路
大家好，首先说明下昨天文章第二段有个错误，应该是“缺氧诱导”，而不是“缺氧敏感”。谢谢小伙伴指出。今天我们要分享的文章是： Zhang A, Zhao JC, Kim J, ...
