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教你用科学杂志喜欢的配色作图——R包ggsci
ggsci是ggplot的主题包，它提供一系列高质量的调色板，其灵感来自于科学期刊、数据可视化库、科幻电影和电视节目中使用的颜色。ggsci中的...
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转录组差异表达分析—ballgown
ballgown是一个差异表达分析RNA-Seq数据的R包 对数据的要求： 1. RNA-Seqreads应已比对到参考基因组上。 2.转录组应...
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NGSQC Toolkit(转录组分析之data cleaning）
NGSQC Toolkit用于进行高通量测序数据的质量检查和数据过滤，具有去接头，去除非ATGC碱基，去除低质量碱基和reads等功能 1安装 ...
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Multiqc（转录组分析之质量评估）
fastqc是一款基于java的软件，能够对测序数据的质量进行评估。一个样本生成一个报告，当样本量过多时，逐一查看样本质量就稍显不方便，mult...
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用vmd将gromacs轨迹转换为动画
1 压缩gromacs的trr轨迹文件 #因为trr格式的轨迹文件包含轨迹 坐标x, 速度v和力f的信息(二进制, 全精度, 可移植)，因此占用...
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kraken软件操作手册
转录组数据质量分析完，想拿kraken软件分析下数据有没有微生物的序列污染 找了全网没看见什么相关的指导文章，看官网的操作手册也很鸡助，所以自己...
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转录组分析文章笔记Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, ...