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基因组Survey 是对基因组的大小、杂合情况进行评估。我们de novo组装一个物种的基因组之前，一般要对所测物种基因组大小有一个估计，以便后续测三代数据的时候，确定大概需...

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基因组组装 1.k-mer 那么我们首先要看一下k-mer是什么。它的定义是：是指将一条序列分成包含k个碱基的子字符串，如果reads长度为L，k-mer长度设为k，则产生的...

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1. Genome Scope2.0介绍 仓库地址：tbenavi1/genomescope2.0: Reference-free profiling of polyploi...

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一、使用Regtag将contig挂到染色体上 二、使用Repeatmasker进行基因组数据屏蔽： 三、基因预测 August使用未屏蔽基因组 August从头预测： ge...

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GenomeScope 是2017年发表在 bioinformatic 的一个工具，这个工具的目的就是处理一些高复杂度的基因组，比如说高杂合度或者基因组非常大的物种。Geno...