你不得不知道的GEO数据库芯片数据分析方法 大家好，我是阿琛。今天来给大家介绍一个新的专题内容---GEO数据库的使用方法。烹饪需要食材，分析需要数据。数据出发，整个研究的第...
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一文解决GEO芯片数据分析80％的工作！建议收藏！
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文献中的热图代码实现（热图标记感兴趣的基因,基础知识）hello，大家好，今天我们来实现一下下面的这张热图 我们最关注的就是图的右边只标记感兴趣的基因，如何实现呢？？？ 准备作图文件 接下来，让我们来实现一下上面的热图。 为了绘...
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【R>>Mfuzz】时间序列分析时间序列分析：对不同时间点（状态）转录组或蛋白表达谱数据，进行模糊c均值聚类（fuzzy c-means clustering, FCM），找出具有相似表达模式的基因或蛋白并...
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R 数据可视化 —— ggsci 配色前言 在绘图时，如何搭配颜色，是一个很让人头疼的问题。今天要介绍的包 ggsci 能大大减轻我们的负担。 ggsci 提供了很多高质量的颜色搭配，其灵感来自于各种 SCI 杂...
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环状直方图和散点图继上次跟大家分享了云雨图和分组直方图之后，今天再跟大家介绍一种适用于统计描述的高颜值图——环状直方图和散点图。它其实是将分组直方图跟分组散点图组合在一起的图。接下来我们开始学...
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如何利用cytoscape画ceRNA互作网络图？说起互作网络图，大家都不陌生。看文献的时候，经常看见相互作用网络图展示了circRNA-miRNA的靶向关系或者ceRNA竞争性网络关系。我们先来看几个图： CircRNA-...
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R package：WGCNA加权基因共表达网络的构建与分析1.安装 载入WGCNA包时会发现部分包没有安装需要手动安装 打开多线程 2.导入数据 2.1 矩阵转置 2.2 查看 3 检查离群样本 4 选择合适的软阈值 sft为一个列...
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R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(四)图例R 数据可视化 —— 聚类热图 ComplexHeatmap(四)图例 前言 忘了说了，直接使用 安装的版本比较老旧，有些功能不支持。比如富文本解析函数 gt_render，...
