目的是重复上图。 背景知识 氟尿嘧啶：5-氟尿嘧啶在体内转化成氟脱氧尿嘧啶（ FdUMP ）是dUMP的类似物，与胸苷酸合酶发生不可逆的结合，抑制其活性。另外5-FU还可以转...
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用GDSC数据库的结肠癌细胞系数据来计算基因与IC50的相关性 -
基因表达矩阵和生存时间的合并通常来说，GEO和TCGA的基因表达数据和临床数据是分开的，为了合并这两个数据，这里使用R进行操作。 基因表达数据如下： 生存数据如下： 在R中读入上述两个数据，然后使用代码...
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基因相关性+药物敏感性分析①高低风险组某基因表达量差异分析 ②药物敏感性分析 安装 pRRophetic 包，首先要安装它的依赖包 依赖包安装成功后，从本地安装pRRophetic压缩包 安装好之后我...
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R语言基础之第二部分 操纵数据/取子集
R语言基础之第二部分：操纵数据取子集 2.1 构建子集[ ]：提取一个or多个类型相同的元素[[ ]]：从列表或数据框中提取元素$ ：按名字从列表or数据框中提取元素 2.1...
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小鼠基因集-GSKB--R进行GSEA富集分析1. 数据集介绍 由于人类基因集富集分析，有msigdb数据库[https://www.gsea-msigdb.org/gsea/downloads.jsp]，上面有各种数据...
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表达矩阵log后进行差异分析关于limma包差异分析结果的logFC解释 http://www.bio-info-trainee.com/1209.html 首先，我们要明白，limma接受的输入参数就...
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火山图-“高下立判”这些东西，换成是高中的我们来做，应该会笑吧，原来长大后的考验也不过如此；其实就是把差异分析结果中的logFC(fold change,limma中给出的结果经由log2处理)...
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