一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息,多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中,基因集分析(Gene Set Analysis...
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一、 简述 为了从基因的表达水平中得到更加具体直观的生物学功能变化的信息,多种基于已知的基因集的分析方法应运而生。其中,基因集分析(Gene Set Analysis...
逐渐感觉到,一些人正在将生信分析带偏,他们着重强调图片的观赏性,而忽视了生信分心的本质不是为了文章凑图片,而是能利用大数据分析观测到wet lab实验不能观测的新视角,提供新...
下面这个图是我在单细胞相关文章中见过的,也算是火山图的变种。可以看出X轴是不同的细胞类型,Y轴是marker基因的fold change(log2),但是不同类别之间他们是不...
在R语言中运行Cibersort共需要三个文件,分别是(1)官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”;(2)自己的表达矩阵;(3)Cibersort代码。 (1)LM2...
R语言如何多线程 相对于python或者perl来说,R给我的感觉是速度不是太快,有时候部分程序是可以用多线程进行并行运算的。 这里介绍一个包parallel。 方法1: p...
前言 众所周知,当你所自己今年比去年更优秀的时候是不可以随便吹牛的,请把你在简书上发文的频率以及质量摆出来! 面对今年和去年的数据,或许你需要一个统计检验的方法... 组间差...
——by不是杀杀Samba是在Linux和UNIX系统上实现SMB协议的一个免费软件,由服务器及客户端程序构成(来自百度百科),简单来说它可以实现服务器端(Linux)与Wi...
方法一在MSigDB下载,网址GSEA | MSigDB | MSigDB Collections。下载到 gmt 格式文件使用 GSEABase 包的 getGmt 函数读...