scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了,自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析(Trajectory)已经有五个年头了。...
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scRNA-seq数据分析想必大家都比较熟悉了,自2014年nature biotechnology提出单细胞拟时分析或称为轨迹分析(Trajectory)已经有五个年头了。...
随着越来越多的scRNA-seq数据集可用,对它们进行比较是关键。主要的应用程序是比较不同实验室收集的具有相似生物学来源的数据集,以确保注释和分析是一致的。此外,随着大量的参...
Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq analysis: a tutoria...
概要 本文主要讨论Seurat对象导入到Monocle中直接进行分析的可行性,分两种情况:①经过数据清洗、标准化和聚类的Seurat对象导入②未经过任何处理的Seurat对象...
SeuratData是一种使用R的内部包和数据管理系统以Seurat对象的形式分发数据集的机制。它代表了一种方便用户访问Seurat中使用的数据集的方法。 我们创建了seur...
单细胞测序有着漫长的过去,却只有短暂的历史---谁说的! 说她漫长是因为到如今也有十几年的历史了,说她段短暂是因为针对单细胞的分析工具越来越有意义开发周期却越来越短。一般生物...