欧阳松

泛癌的基因表达量一般可以用TCGA和GTEx实现，但是肿瘤细胞系一般用CCLE临床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...

生信学霸

01—研究背景 网址导航 http://sangerbox.com/Tool 点击“快速小提琴绘制工具” 02—使用方法 1.1 输入数据格式 ---------- 点击添加...

科研菌

今天跟大家分享的是2020年1月发表在CancerCell International（IF：3.439）杂志上的一篇文章Overexpression of kinesin ...

博士苑

转录因子（Transcriptionfactor，TF)是一种能与特异DNA序列结合的蛋白，可以单独或与其他蛋白形成复合体，提高或阻断特定基因对RNA聚合酶的招募，调控基因的...

重新开始_xy

在分析基因组数据时，我们有时候只需要基因组中某个部位的信息，比如涉及编码蛋白功能就只需要CDS序列，研究miRNA与mRNA互作时，只需要3‘UTR序列，那么如何简单快速的得...

小贝学生信

「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索 系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据 - 简书GEO挖掘实战二、差异分析及富集分析 - 简书GEO挖掘实战三、GSVA - 简书GE...

生信start_site

之前的文章里已经按照教程进行了TCGA数据库的一些练习（RNA-seq、芯片、生存分析），现在学习TCGA甲基化数据的分析过程。 参考文章：1.甲基化的一些基础知识2.Mak...

小洁忘了怎么分身

花花写于2020-7-15。今天一口气写了几个新的处理tcga数据的函数。加在tinyarray里了，1.3.1版本以上可用~当前版本有一个小缺点，因为有一步用到了字符型和数...