2021-06-26 一. 为什么要做基因组Survey? Survey分析要做什么数据准备?(1)QC方法介绍(2)NT方法介绍 1.为什么要进行Survey分析?2.Su...
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直接看本文最下面下载脚本,区分SRR长度,下载fq 一、prefetch 下载 cat SraAccList.txt 二、 Ascp 快速下载 批量下载 ,首先创建一个ac...
最近一直在折腾结构变异SV的鉴定,SV的鉴定软件虽然很多,但是在最近的两篇基因组文章里面,主要用的是smartie-sv和bayesTyper,其中smartie-sv主要用...
之前call snp 都是用samtool mpileup 以及bcftools view进行,但是版本更新忒快,故现在可直接使用bcftools mpileup 以及 bc...
2020年3月8日,这几天我的心情很不好。又或是今天,3月8日。原先的妇女节,在现在被叫做女神节。是呀,又是节日,心生不快,因为,我眼前的这个人,很少很少会主动送我礼物,更是...
现有比对工具在做mapping之前,都需要下载对应物种的参考基因组做index,而如何选择合适的参考基因组是一件非常重要的事情。 现有的参考基因组存储网站三个: UCSC 的...
生物信息学分析和作图是科研狗们的必备技能。近几年,随着数据类型的增多,excel、SPSS等常用软件已经不能满足科研需求了。R语言以其方便、快捷的优势,迅速获得许多编程技术不...