一、概述 在编写shell脚本时经常会遇到一个问题，即传递命令行参数。如果只考虑最简单的应用场景，即所有参数都按顺序，显示传递进去，shell脚本倒是非常方便，终端直接传...
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Shell脚本解析命令行参数——Argparse（填坑）
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R语言-制作motif的PWM一、PWM与PFM的介绍 motif指的是转录因子偏好结合的DNA序列模式或RNA结合蛋白偏好结合的序列模式，一般使用PWM来表示motif。 制作PWM的过程如下： 首先计...
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ggplot2-绘图-箱线图前面的啰嗦 本教程对绘图所需数据和绘图过程进行了一步步的解释，稍显啰嗦，没时间细看或不想一步步看的朋友可以直接点击目录最后一节:箱线图完整版代码 绘图数据说明 用到的数据是m...
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bcftools常用命令详解http://samtools.github.io/bcftools/bcftools.html https://www.biostars.org/p/95013/ 下载 1...
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biostar handbook(十)|如何进行变异检测什么是基因组变异 基因组变异是一个定义比较模糊的概念. 所谓的变异是相对于一个完美的“参考基因组”而言。但是其实完美的“参考基因组”并不存在，因为我们只是选择某一个物种里的其...
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Call变异？就是召唤啦！刘小泽写于18.8.10，补充于18.8.14-15这之间经历了第一期授课结课，（回中山办购房手续）遥墙机场读了100多页生信书籍，飞往珠海机场被台风滞留（差点回不了中山的家...
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Ubuntu18.04 下的多线程下载工具mwget安装Ubuntu18.04 下的多线程下载工具mwget安装 安装mwget 下载：wget http://jaist.dl.sourceforge.net/project/km...
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测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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Windows路径转成Linux子系统的路径
需求说明 自己用的是windows电脑，也开启了windows下面的linux子系统，有时候需要在linux子系统里面操作一些文件，而这些文件的路径是windows形式，wi...
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10x Genomics RNA-seq 原理详解近期的一系列际遇都再次论证了我真的是一个靠运气闯荡江湖的人，鬼使神差的混入了一个超棒的实验室，并且受到了同伴和室友在工作和生活上的无私的照顾。日子像梦一样美好，我只想时间走的...
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Python：根据艾宾浩斯遗忘曲线计算复习日期
前言：最近开始复习考研英语了，每天做阅读记笔记，同时每天需要复习前几天的笔记，考虑到艾宾浩斯遗忘曲线这个东西，便写了一个小脚本来计算每一天记录的笔记需要复习的日期。 函数说明...
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Python：对列表或者字符串取子集
如何实现以下功能：根据给定下标从列表或字符串中取出对应的元素？ 代码示例如下： 方法1：使用np.array将列表转化为ndarray结构，然后可以直接将多个下标（一个lis...
