1、验证microRNA同mRNA靶向互作。将待测基因的3’UTR序列插入报告基因载体,再共转入该microRNA,检测荧光素酶活性下降,则提示为其靶序列。 2、验证mic...
对于新手小白做这些大实验时可能不知所措,为了方便学习,将相关实验进行归纳总结: 原理 凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互...
导读 利用富集分析,我们可以把很多看着杂乱的差异基因总结出一个比较整体反应事件发生的概述性的句子。 例如:TP53信号通路和胃癌的发生有关。而不是说BAX、BID、ABL1、...
写在前面:非常感谢CJ开发出如此强大的TBtools工具,作者详细讲解了基因家族的分析过程和意义,课程购买地址,讲的很棒,可以试听。 一共分为4个部分TBtools基因家族分...
今天在一个微信群里看见有人问下面两幅图用R语言如何实现 第一幅就是散点图 两列数据x,y用来控制散点的位置,一列变量用来映射颜色,Frequency用来映射大小。这个实现起来...
今天推文重复的图来自于 论文Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestica...
ggpubr ggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。 1.安装和加载 由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.pac...
其实前面在学习的时候也陆陆续续的用过一些拼图的包,像par,cowplot,patchwork等。但是,感受下来好像最好用的还是patchwork,所以今天详细的学习一下。因...
写在前面 早前已经推过《新手eggNOG-Mapper详细教程》,但仍然有很多人遇到使用问题。换句话,可能那个教程不能彻底解决大伙遇到的问题。于是我决定写一个完美的教程,彻底...
=====WGCNA实战(一)====== 我们第一个实战采用的是官方提供的矩阵。 https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coexpr...
其实我一直没用过WGCNA,因为分析网络的方法有很多,但是大家好像都更爱用这个。最近帮人分析的几组数据,他们指名要用WGCNA分析,所以就学习一下。 =======WGCNA...
WGCNA
WGCNA用法详情http://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1111379.html WGCNA基本概念[http://blog.genesino.com/2...
主成分分析,即Principle Component Analysis (PCA),是一种传统的统计学方法,被机器学习领域引入后,通常被认为是一种特殊的非监督学习算法,其可以...
这个系列,我们陆续的学习一些散点图的技巧,其实像前面的火山图,PCA图等均是散点图,只不过对象和数据类型不太一样而已。 今天我们学习如何给散点图添加拟合曲线以及置信区间。下面...
作为R语言基础之一的 %>% 应用非常广泛,但是我却一直没有系统地学习,实在不应该,今天研究记述一下。 什么是%>% %>% 作为一种管道符,意思是 %>% 把左边的输出传递...