前言 最近看一篇文章中提到 WSL 中已经支持 Docker 运行了，最初不以为意以为还是千篇一律的标题党 ( Docker Client + Docker Desktop ...
发简信
IP属地：甘肃
-
WSL 中 Docker 使用总结
-
（二）假设检验之——T检验假设检验也叫显著性检验，是以小概率反证法的逻辑推理，判断假设是否成立的统计方法，它首先假设样本对应的总体参数（或分布）与某个已知总体参数（或分布）相同，然后根据统计量的分布规...
-
VCF文件INFO列的一些信息意义转自：GATK4.0和全基因组数据分析实践（下） QualByDepth（QD） QD是变异质量值（Quality）除以覆盖深度（Depth）得到的比值。这里的变异质量值就是...
-
-
应该是版本原因，我测试的也是也遇到你说的那个问题，但是更换完pysam的版本就没有问题了，pysam=0.11.2.2
VarBen：NGS变异数据模拟软件
VarBen（Variant Benchmark） 2021年3月3号，来自 国家卫生健康委临床检验中心、中国科学院计算技术研究所等单位的研究人员开发了肿瘤突变数据模拟软件V...
-
pandas agg函数使用方法DataFrame.agg（func，axis = 0，* args，** kwargs） func : 函数，函数名称，函数列表，字典{‘行名/列名’，‘函数名’} 使用指...
-
我的生信自学心得分享
这是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 从2016年，我开始自学生物信息，那个时候，为了加深自己学习，所以就不间断的在网上分享我的学习笔记。 我有一个自己的博客，xu...
-
WGCNA（1）：R包安装及数据导入清洗WGCNA：加权基因共表达网络分析，简而言之，就是将基因划分为若干个模块，探究与表型数据与基因模块之间的相关关系，并找到模块中的核心基因。 适用于复杂的数据模式，推荐5组(或...
-
宏基因组数据分析流程代码熊金波实验室出品 整理归纳：Larry 本次学习使用的服务器IP地址和其用户名账户密码如下： 地址：gs0.genek.tv 用户名：u3276 密码：genek.tv（建议...
-
@橙子嘿哟喂 40%可能不行，一般都是数据的问题，我的也是这个原因，人类的比对率高很多，其他物种可能也得75%多
比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
-
好的，感谢回复
比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
-
你好，想请教一下star比对结果的比对率比较低，只有50%多，*.Log.final.out文件中
% of reads unmapped: too short 的比率非常高，造成这种结果的原因是什么呢，谢谢！比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。STAR能够发现非典型拼接和嵌合...
-
可变剪切软件CASH测试
可变剪切介绍： 什么是基因的可变剪切？ 有些基因的前体mRNA（pre-mRNA）通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的mRNA剪接异构体，这一过程称为可变剪接（...
-
R使用笔记: heatmap.2绘制热图笔记内容：热图的应用意义包的安装scale的作用作图细节：系统发生树，label, color key的问题等补充：添加多行ColSideColors补充：heatmap.3...
-
-
如何将WGCNA导出的基因共表达网络进行可视化（cytoscape软件的使用）WGCNA分析过程中，你可以得到edge和node的文件，里面有你某一个module里所有基因相互之间的connectivity的weight值，根据这些值你可以将它们之间的...
