HPA数据库全称The human protein atlas，即人类蛋白图谱，里面有关于蛋白研究的许多信息，如蛋白细胞内定位、在人体组织的表达情况，在肿瘤组织的表达情况等，...
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HPA数据库更新脑图谱、血液图谱与代谢图谱 -
都挺好的，看哪个方便吧
各类统计方法R语言实现（二）
各位小伙伴们大家好，今天是我们的系列推文“各类统计方法R语言实现”第二篇，今天介绍的主要内容有：正态性检验、方差齐性检验、t检验、近似t检验。 t检验 此处选用的数据集仍是R...
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新版PubMed正式上线不知不觉，那个我们熟悉的旧版PubMed成功完成了他的历史使命，正式退役。 新的界面乍一看比原来简洁不少，那这个新版究竟如何使用呢？让我们继续往下看。 如图所示，我们常用的功...
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免疫浸润进入2.0时代很久没有做个免疫浸润的分析了，转眼间，两大主流免疫浸润工具都发布了2.0版本，CIERSORT更新为CIERSORTx，timer更新为timer2.0。 接下来，小伙伴们就...
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R语言统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验今天是各类统计方法R语言实现的第13期，我们主要介绍R语言统计系列第13篇-K-M生存曲线与logrank检验。 ### 生存分析 生存分析是将事件的结果和出现这一结果经历的...
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R语言统计系列第12篇-泊松回归今天是各类统计方法R语言实现的第12期，我们主要介绍泊松回归。 泊松回归 计数型，如某地区某年发生肿瘤患者的人数等，常用泊松回归，假设因变量Y服从泊松分布。 此处分析的是ro...
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R语言统计系列第11篇-Logistic回归
今天是各类统计方法R语言实现的第11期，我们主要介绍Logistic回归。Logistic回归属于广义线性回归，因此我们从广义线性回归讲起。 广义线性回归 线性回归模型要求因...
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统计（九）_置换检验
对于正态分布或其他已知分布的数据，有相应的假设检验与置信区间的计算方法，但是当数据抽样自未知或混合分布、样本量过小、存在离群点、基于理论分布设计合适的统计检验过于复杂且数学上...
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重复cell文章的图在上次的推文中，我们介绍了肿瘤相关巨噬细胞呈现出一种M1和M2亚型的混合状态，有小伙伴要问了，这个结论真的是一种普遍规律吗？会不会是一种偶然现象？ 的确，如果你是做基础研究的...
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各类统计方法R语言实现（八）今天是各类统计方法R语言实现的第八期，我们主要介绍选择“最佳”回归模型与深层次分析。 选择“最佳”回归模型 当我们构建回归方程时，我们一方面需要考虑是否去除不显著的变量、是否...
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各类统计方法R语言实现（七）今天是各类统计方法R语言实现的第七期，我们主要介绍多重共线性、异常观察值的分析和回归模型改进措施。 多重共线性 多重共线性是指线性回归模型中的解释变量之间由于存在强相关关系而...
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各类统计方法R语言实现（六）今天是各类统计方法R语言实现的第六期，我们主要介绍多元线性回归、回归诊断。 多元线性回归 多元线性回归指的是用多个自变量预测一个因变量，且自变量与因变量之间为线性关系，在分析...
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R语言统计系列汇总目录
转眼间，我们的R语言统计系列已经经历的10期，我们从统计学最基础的统计描述讲到置换检验和自主法等内容，算是完成了统计的入门。 在这篇推文里，我一方面将汇总归纳之前的10期推文...
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挖掘GEO单细胞数据能发表5分文章？本文题为Systematic expression analysis of ligand-receptor pairs reveals important cell-to-c...
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单细胞测序识别乳腺癌异质性和免疫细胞谱今天跟大家分享的是发表在NATURE COMMUNICATIONS杂志上的一则一篇文章：Single-cell RNA-seq enables comprehensive t...