前言 青藏高原是世界上海拔最高、面积最大的高原,平均海拔4500米。由于低氧、低温和强紫外线等恶劣的环境条件,生活在高海拔环境中的物种面临着巨大的选择压力。 这种严酷的高海拔...
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前言 青藏高原是世界上海拔最高、面积最大的高原,平均海拔4500米。由于低氧、低温和强紫外线等恶劣的环境条件,生活在高海拔环境中的物种面临着巨大的选择压力。 这种严酷的高海拔...
一、数据准备 首先,选取不同物种的Protein数据集:Arabidopsis_thaliana.fa;Citrus_grandis.fa;Dimocarpus_longan...
作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量!作业,理解测序reads,GC含量,质量值,...
策略 hmmsearch + blast 单独使用或者组合使用 hmmsearch可以做两次,第一次使用pfam中的多序列比对结果构建模型进行搜索,筛选过结构域后,使用本物种...
一、基因家族基础知识与研究思路介绍 1.基因家族简介 基因是染色体上一段可以发生转录的区域(内含子外显子启动子)。转录本才是基因的研究实体,转录本transcript(别名 ...
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明晰概念 基因是染色体上一段可以发生转录的区域 基因≠CDS 基因应该包括:CDS 内含子 UTR 启动子 可转录的区域是多变的 我们做分析的时候常用的是蛋白序列,而蛋白序列...
Data preparation 继续上次的内容,下载好数据后就可以正式开始鉴定了。首先回顾一下,下载好的数据。 基因组序列信息,存储基因组序列信息的.fasta文件。还有其...