最近看了几篇关于共线性分析的微信/简书推送，发现不少研究人员把“编码基因共线性”错误地描述为“全基因组共线性”。这是两个完全不同的概念，前者主要是基于蛋白水平，蛋白的保守性很...
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聊聊“基因组共线性” -
生物数据库之二级蛋白质数据库二级蛋白质数据库数目众多，我们挑几个常用的给大家介绍。 一、结构域家族数据库 Pfam Pfam 数据库是一个蛋白质结构域家族的集合，包括了一万六千多个蛋白质家族。蛋白质一般...
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这或许是我写的最全的BLAST教程Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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病毒是如何包装成熟的？
80年代末，美国《变形金刚》动画片引入国内，那时对霸天虎的金刚合体“大力神”喜爱无比。大力神由铲土机、清扫机、推土机、吊钩、拖斗和搅拌机组装而成，合体之时坚实有力、节奏铿锵、...
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病毒的毒力：被误解的病毒学概念 II
我去年回校工作后，几乎天天和研究生待在一起。我会发现他们科研方面的一些错误，作为科研工作者，我愿将我的所学与他们分享，并纠正他们的错误。今天就涉及到他们嘴里经常叨念的，但几乎...
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病毒的结构和非结构蛋白：病毒学常见概念 III
2010年我硕士毕业答辩，当天的答辩主席是业界声名显赫的童光志教授。现在回想，那天整体普遍答辩的一般，当童教授向某同学提问关于猪瘟病毒结构和非结构蛋白的问题时，该同学竟然不知...
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病毒螺旋对称结构：病毒学常见概念II
大学首门化学课是《普通化学》，应用率虽不及后来的《生物化学》，但某些概念至今仍会帮助我去思考问题。虽已过去17年，但印象很深刻地是，理学院的张钒老师用不太标准的普通话给我们讲...
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病毒学番外篇：反向遗传的力量
如果选出病毒学领域最伟大的技术，反向遗传学应该当之无愧！大多数病毒，若想深入研究其机理，通常回避不了反向遗传。反向遗传学这个概念实质上是针对于传统遗传学而言的。用我博士舍友刘...
